Toepassing van dierlijke mest en compost geeft gelegenheid tot opbouw van organische stof in de bodem. Ook gewasresten, groenbemesters en vanggewassen kunnen hiertoe bijdragen. De aanvoer van organische stof zou minstens gelijk moeten zijn aan de afvoer, omdat nieuw aangevoerd materiaal binnen een jaar grotendeels weer is afgebroken.

Te hoge doseringen van compost en/of dierlijke mest kunnen juist schade geven aan het bodemleven. Ook kunnen te hoge doseringen leiden tot hoge zoutconcentraties in de bodem waardoor het cultuurgewas moeilijk kan gedijen van de bodem.

Om de juiste aan te voeren hoeveelheden vast te stellen moet er eerst worden bekeken wat de uitgangspositie van de bodem is. Aan de hand daarvan kan een gericht advies worden gegeven. Daarbij is het ook belangrijk om de fysische en chemische eigenschappen van de aan te voeren compost en/ of dierlijke mest inzichtelijk te hebben. Omdat er veel verschillende soorten compost worden aangeboden is een productanalyse een goede basis voor een gericht advies.